Бактериальная мягкая гниль (еще называют — мокрая гниль) является заболеванием, которое в первую очередь поражает лук, но также может развиваться и на чесноке. Возбудителем заболевания являются бактерии Erwinia carotovora (и несколько других), которые попадают в растения через повреждения.
Латентный обычный вирус чеснока относится к роду Карлавирусов (carlaviruses), для которых растения служат естественными хозяевами. Карлавирусы могут нанести серьезный ущерб чесноку, особенно в совокупности с Потивирусами
Вирусы также являются возбудителями заболеваний на чесноке. Самым распространенным является Вирус желтой карликовости лука.
Пероноспороз или ложная мучнистая роса чеснока — распространенное грибковое заболевание, возбудителем которого является Perоnospora destructor Casp. В отдельных случаях приводит к уничтожению большей части урожая выращиваемых культур.
Возбудителем заболевания чеснока Розовая гниль корня, является почвенный гриб Phoma terrestris. Чаще эта болезнь проявляется в южных регионах.
Черная плесень (аспергиллез) – заболевание лука и чеснока, вызываемое некоторыми видами гриба Aspergillus, которое чаще возникает при выращивании лука и чеснока в теплых и сухих условиях южных регионов. В большей степени черная плесень поражает лук, чем чеснок.
Пенициллез чеснока – заболевание чеснока, вызванное грибками рода Penicillium. Это род грибов, из некоторых видов которого, получают антибиотик пенициллин.
Ржавчина чеснока – это заболевание, возбудителем которого является ржавчинный гриб Puccinia alli (синоним Puccinia porni). Также ржавчина поражает лук, лук-порей, лук-батун.
Шейковая гниль чеснока – заболевание чеснока и лука, вызываемое грибком Botrytis. Это заболевание наносит чесноку и луку самый значительный урон при хранении.
Белая гниль чеснока по своим симптомам очень похожа на фузариозную гниль, однако она атакует растущий чеснок быстрее и с большей вероятностью погубит все растение. Белая гниль донца предпочитает более низкие температуры. Замачивание посадочного материала чеснока в горячей воде перед посадкой может уменьшить вероятность белой гнили, но будьте осторожны — слишком высокая температура может убить сам чеснок.